摘要：本试验选取水牛、奶牛、湖羊、兔子为研究对象,研究不同草食家畜胃肠道中细菌的多样性差异。通过瘤胃瘘管技术,采集3头成年水牛、6头泌乳后期奶牛、4只4月龄左右湖羊的瘤胃内容物;屠宰取5只兔子的盲肠内容物。样品以最快速度置入厌氧甘油培养基中, 80℃厌氧保存。采集的样品用16烷基3甲基溴化铵cetrimonium bromide,CTAB方法提取DNA,QIAamp DNA Stool试剂盒纯化DNA。用519F和907R细菌16S rRNA基因引物PCR扩增V3区,PCR产物经割胶纯化后进行焦磷酸测序。利用mothur软件,以细菌16SrRNA基因序列相似度大于97%作为相同的操作单元operational taxonomicunit,OTU,分析瘤胃及盲肠内容物中细菌多样性,计算所测序列数量的覆盖率。结果显示测序获得优质序列,水牛26 244条,其覆盖率为96%;奶牛30 357条,覆盖率为94%;湖羊21998条,覆盖率为95%;兔子17 184条,覆盖率为93%。水牛、奶牛、湖羊和兔子OTU数分别为1953、3497、2311、2493,主要归入Bacteroidetes、Proteobacteria、Firmicutes三大门。在水牛、奶牛和湖羊瘤胃及兔子盲肠内容物细菌中Bacteroidetes所占的比例分别是31%、58%、69%和25%;Proteobacteria所占的比例分别为8%、8%、0.8%和4%;Firmicutes所占的比例分别为54%、24%、23%和62%。热图和相似度分析结果显示奶牛、湖羊和水牛亲缘较近,与兔子较远。但兔子与水牛、奶牛和湖羊均具有86个相同的OTU,其中普雷沃氏菌属Prevotellaceae占22个,毛螺旋菌属Lachnospiraceae和瘤胃球菌属Ruminococcaceae各占7个。结果提示水牛、奶牛和湖羊瘤胃及兔子盲肠内容物中细菌多样性存在差异,奶牛细菌多样性最丰富,兔子和湖羊次之,水牛最少。水牛瘤胃和兔子盲肠内容物中细菌以Firmicutes居多,奶牛和湖羊中Bacteroidetes占大多数。兔子盲肠中寄居着与瘤胃相似的球菌。 作者单位： 基金： 分类号：S816 ？ 欢迎：、、
支持CAJ、PDF文件格式，仅支持PDF格式
看到此处说明本文对你还是有帮助的，关于“水牛 奶牛和湖羊瘤胃及兔盲肠内容物中细菌的多样性分析”留言是大家的经验之谈相信也会对你有益，推荐继续阅读下面的相关内容，与本文相关度极高！
