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带有害生物，就有可能给当地生态安全带来隐患。为此，北京市园林绿化局和北京海关专门开发了北京世园会植物检疫追溯系统，所有进园苗木必须按要求经严格检疫后方能进园，并佩戴含有芯片的追踪标识牌，以便对植物进行全过程溯源监管。
据悉，为了保证入园的每一棵树都健健康康，林业工作人员几乎每天都要在园区走上两三万步，一棵棵 看树 ，反复检查，晚上还要给树木打药，防治病虫害。北京海关技术中心还与延庆区林业保护站合作，在园区外5公里范围内设置了40个预警监测点，在园区内设置80个监测点，并安装500余套有害生物诱捕装置，定期开展有害生物巡查监测和普查，以第一时间发现潜在疫情风险，及时采取措施，避免有害生物侵入。
此外，北京市林业保护站还积极开展绿色防控工作，释放害虫相应的生物天敌开展 以虫治虫 ，还在园区定制安装了13个 昆虫旅馆 ，采用自然材料、依照昆虫习性制作，为昆虫提供繁殖、栖息及越冬的场所。
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